Diffusion d'une souche hautement résistante aux antibiotiques de Vibrio cholerae, l'agent du choléra

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Dans une lettre publiée le 11 décembre dans la revue New England Journal of Medicine, une équipe dirigée par des chercheurs de l'Institut Pasteur de France décrit la propagation à longue distance d'une souche de choléra épidémique hautement résistante aux antibiotiques.

Cette souche de choléra hautement résistante aux médicaments semble se propager en Afrique de l'Est. 

Les auteurs indiquent que la souche AFR13 7PET de Vibrio cholerae O1 est résistante à 10 antibiotiques, dont l'azithromycine, la ciprofloxacine et les céphalosporines de troisième génération. L'azithromycine et la ciprofloxacine sont deux des trois antibiotiques recommandés, en plus de la doxycycline, pour traiter le choléra.

Le choléra provoque une diarrhée et une déshydratation sévères qui peuvent rapidement mettre la vie en danger si elles ne sont pas traitées. Si les cas bénins se traitent principalement à l'aide d'une solution de réhydratation orale, les cas plus graves peuvent nécessiter l'administration d'antibiotiques.

La souche AFR 7PET appartient à une lignée de V. cholerae qui a été introduite en Afrique de l'Est depuis l'Asie du Sud en 2013-2014, indiquent les chercheurs. Mais elle a été identifiée pour la première fois lors d'une épidémie massive de choléra au Yémen qui a débuté en 2018 où elle a touché plus de 2 millions de personnes. Elle a également été confirmée dans des cas de choléra dans le sud et l'est du Liban en 2022.

En utilisant les données des systèmes de surveillance du choléra de plusieurs pays européens, les chercheurs ont constaté que la souche AFR 7PET s'est maintenant propagée en Afrique de l'Est.

Ils ont identifié des isolats appartenant à cette souche chez des voyageurs européens revenant du Kenya en 2023, et en 2024 chez des patients atteints de choléra sur l'île française de Mayotte, située au large de la côte sud-est de l'Afrique. Les cas observés à Mayotte concernaient initialement des patients en provenance de Tanzanie et des Comores.

Les chercheurs pensent que la souche a contribué aux grandes épidémies de choléra au Kenya en 2022 et en Tanzanie et aux Comores en 2024, mais ils affirment que l'ampleur de son implication doit être confirmée.

Le rapport s'inscrit dans le contexte d'une augmentation du nombre de cas de choléra dans le monde depuis 2021. Selon la dernière mise à jour de l'Organisation mondiale de la santé (OMS), 486 760 cas de choléra et de diarrhée aqueuse aiguë et 4 018 décès ont été signalés dans 33 pays de cinq régions de l'OMS entre janvier et le 27 octobre 2024.

Si la nouvelle souche qui circule actuellement acquiert une résistance supplémentaire à la tétracycline, cela compromettrait tous les traitements antibiotiques oraux possibles.

Bien que le rapport de l'OMS montre que les cas sont en baisse cette année, le nombre de décès dus au choléra en octobre était 54 % plus élevé qu'en octobre 2023. Selon l'OMS, ce pic de décès peut être attribué en partie aux endroits où des flambées de choléra se sont produites cette année, comme les zones touchées par des conflits où l'accès aux soins de santé est compromis, les régions où des inondations massives ont endommagé des infrastructures essentielles et les zones où les installations médicales sont inadéquates.

Les auteurs de la lettre affirment que ces résultats appellent à une surveillance transfrontalière en temps réel de la souche AFR13 7PET.

« Cette étude démontre la nécessité de renforcer la surveillance mondiale de l'agent du choléra, et en particulier de déterminer comment il réagit aux antibiotiques en temps réel », a déclaré l'auteur principal de la lettre, le docteur François-Xavier Weill, dans un communiqué de presse de l'Institut Pasteur. « Si la nouvelle souche qui circule actuellement acquiert une résistance supplémentaire à la tétracycline, cela compromettrait tous les traitements antibiotiques oraux possibles.

Source : Center for Infectious Disease Research and Policy

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