France : l'épidémie de grippe poursuit sa progression, la circulation du SARS-CoV-2 diminue et l'épidémie de bronchiolite perdure.

Publié le 12 jan. 2024 à 12h35

Biographie

Médecin biologiste.

En France, en semaine 1 de 2024, les l'activité des infections respiratoires aigües est stable en médecine de ville. Les indicateurs sont en diminution à l'hôpital, excepté chez les 65 ans et plus chez qui une hausse est relevée.

1. Grippe saisonnière

Selon les données SOS Médecins, l’activité en médecine de ville était en augmentation (9,4% des actes médicaux soit +0,7 points vs S52). A l’hôpital, les indicateurs aux urgences étaient en baisse (1,6% des passages aux urgences soit -0,1 point vs S52) excepté la part des cas hospitalisés pour grippe parmi l’ensemble des hospitalisations qui restait stable à 1,5%.

Dans l'Hexagone, l’épidémie continue de progresser avec cette semaine le passage de la région Pays de Loire en épidémie. Onze régions au total étaient en épidémie (Auvergne-Rhône-Alpes, Provence-Alpes-Côte d'Azur, Occitanie, Bourgogne-Franche-Comté, Grand Est, Île-de-France, Hauts-de-France, Centre-Val de Loire, Nouvelle-Aquitaine, Corse et Pays de Loire) et deux en phase pré-épidémique (Bretagne, Normandie).

La circulation des virus grippaux s’est intensifiée en S01 avec une nette augmentation des taux de positivité en ville et à l’hôpital. En médecine de ville, le taux de positivité était en augmentation en S01 (34,1% soit +12,4 point vs S52) et à l'hôpital (10,9% soit +0,5 points vs S52).

Depuis la S40, 131 cas graves de grippe ont été signalés, dont 74% avaient plus de 18 ans. Pour les 110 cas pour lesquels le virus a été typé, 107 (97%) virus de type A ont été identifiés. Parmi les 85 cas pour lesquels le statut vaccinal était renseigné, 74 (87%) n’étaient pas vaccinés contre la grippe. Neuf décès ont été signalés, dont 6 chez les 65 ans ou plus (données non consolidées).

En ville, parmi les 2 187 prélèvements testés depuis la semaine 40, 155 virus grippaux ont été détectés, la très grande majorité étaient de type A : 109 A(H1N1)pdm09, 38 A(H3N2), 7 A non sous-typés, et 1 B/Victoria. A l'hôpital, parmi les 160 046 prélèvements testés depuis la semaine 40, 5 477 se sont avérés positifs pour un virus grippal (3,4%), dont 4 704 virus de type A non sous-typés, 426 A(H1N1)pdm09, 172 A(H3N2) et 175 virus de type B.

Les analyses de caractérisations antigénique et génétique réalisées par le CNR des virus respiratoires sur les virus grippaux A(H3N2) et A(H1N1)pdm09 co-circulant ces dernières semaines indiquent que :

  • les virus A(H1N1)pdm09 caractérisés sont antigéniquement apparentés à la souche vaccinale présente dans le vaccin hémisphère nord 2023-24 (A/Victoria/4897/2022 clade 5a.2a.1). Le séquençage montre que les virus circulants appartiennent aux clades 5a.2a ou 5a.2a.1.
  • les virus A(H3N2) caractérisés présentent un profil antigénique non totalement apparenté à la souche vaccinale présente dans le vaccin hémisphère nord 2023-24 (A/Darwin/9/2021 clade 2a). Ils sont antigéniquement apparentés aux souches du clade 2a.3a.1 présent dans le vaccin hémisphère sud 2024 (A/Thaïland/8/2022 et A/Massachusetts/18/2022). Le séquençage montre que les virus circulants appartiennent aux clades 2a.3a ou 2a.3a.1, ce dernier clade étant actuellement majoritaire parmi les H3N2. Pour les virus A(H3N2), la protection vaccinale pourrait être plus faible.

Dans les DROM, la Guyane et la Guadeloupe étaient en épidémie  cette semaine. La Martinique est passée en phase pré-épidémique et Mayotte en phase post-épidémique.

Rappelons que la campagne de vaccination contre la grippe a débuté le 17 octobre 2023 dans l'Hexagone.  

2. Bronchiolite

Le pic de l'épidémie de bronchiolite a été atteint en semaine 48 dans l'Hexagone. En semaine 01, l'épidémie de bronchiolite se poursuivait en France dans huit Régions. Cinq régions étaient en phase post-épidémique : quatre régions depuis S01 (Centre-Val de Loire, Ile de France, Normandie et Pays de Loire) et la Bretagne depuis S52. L'ensemble des DROM, à l'exception de la Réunion, est toujours en phase épidémique.

En semaine 01, les indicateurs syndromiques étaient en diminution pour la cinquième semaine consécutive. Chez les moins de 2 ans, la bronchiolite représente respectivement 5,6% (-1,5 points vs S52), 12,5 % (-2,4 points) et 26,9 % (-6 points) des actes de SOS médecins, des passages aux urgences et des hospitalisations après passage aux urgences.

Le taux de positivité pour le VRS dans les prélèvements naso-pharyngés tous âges était en augmentation en ville (4,5 % soit +0,7 points vs S51) et en baisse en milieu hospitalier (7,8 % soit -0,9 points). D’autres virus susceptibles d’induire des bronchiolites continuent de circuler.

3. Covid 19

Concernant le covid, les indicateurs syndromiques continuaient de baisser en ville et à l'hôpital dans toutes les classes d’âge.

Depuis la S40, 433 cas graves de covid ont été signalés, dont 93% étaient âgés de plus de 18 ans. Parmi eux, la majorité étaient des hommes et la présence de comorbidité était reportée pour 89% des cas. Soixante-six décès ont été signalés, dont 53 chez les 65 ans et plus (données non consolidées). Sur les 221 cas pour lesquels les informations concernant la vaccination étaient connues, seuls 13 (5,8%) avaient bénéficié d'un rappel datant de moins de 6 mois.

Le taux de positivité des prélèvements étaient en diminution en médecine de ville (16,9% soit -7,7 points vs S52) et à l'hôpital (13,9% soit -3%) . Le taux de positivité des tests en laboratoires de biologie médicale était de 14,2% (-5,2 points vs S52). Dans les eaux usées, le nombre de positif a chuté de 49%.

Concernant la surveillance génomique, la dynamique d'augmentation du variant BA.2.86, qui est aujourd'hui le majoritaire en France hexagonale, se poursuit et celle-ci est portée majoritairement par JN.1, sous-lignages de BA.2.86. Le variant EG.5 continue de diminuer (8% des séquences de l'enquête flash du 18 décembre 2023).

A l’issue de la semaine 52, la couverture vaccinale covid de la campagne d’automne 2023 pour les personnes âgées de 65 ans n'a pas progressé. Elle est de de 29% (+0,3% sv S52) [21,2% des 65-69 ans (+0,2), 26,7% (+0,3) des 70-74 ans, 34,5% des 75-79 ans (+0,3) et 34,9% (+0,7)  des 80 ans et plus]. Depuis le 17 octobre 2023, 30% des vaccinations contre la covid chez les personnes âgées de 65 ans et plus ont été réalisées en même temps qu’un vaccin contre la grippe.

Dans ce contexte, l’adoption systématique des gestes barrières en complément de la vaccination demeure un moyen efficace pour se prémunir des infections respiratoires et de leurs complications en limitant le risque de transmission de ces virus à l’entourage : le port du masque en cas de symptômes, dans les lieux fréquentés et en présence de personnes vulnérables, le lavage des mains et l’aération régulière des lieux clos.

Source : Santé publique France.